微波萃取儀應用於有機合成反應，反應速度比常規方式要加快10-數千倍。並且能合成常規方法難以合成的物質

MCR-3微波化學反應器技術發展方興未艾，科學界已對微波能在萃取及合成領域的應用投入了較大的關注。由於微波的致熱效應，非致熱效應，誘導催化效應等作用機理的特殊性，對於化學領域特別是有機合成領域帶來了很大的衝擊。微波應用於有機合成反應，反應速度比常規方式要加快10-數千倍。並且能合成常規方法難以合成的物質。迄今為止，研究過並取得效果的研究有：Diels-Alder環加成反應，重排反應，酯化反應等